تؤثر الأحمال الميكروبية التي قد تحدث في البيئة التي تزرع فيها الشتلات على إنتاج الشتلات والمحصول. يتم توفير تطهير جيد للغاية ومستمر باستخدام الماء المعالج بالأوزون مع نظام أوتوماتيكي بالكامل على شكل تقطير أو نبع في زراعة الشتلات. مرة أخرى ، يتم استخدام غاز الأوزون بشكل فعال في تطهير المخلفات حيث توضع الشتلات. من خلال تدمير جميع البكتيريا والميكروبات في بيئة الدفيئة باستخدام مولدات الأوزون ، يمكن تحقيق نمو أكثر صحة وأسرع للشتلات.